260比230值多少合適
⑴ RNA質量中260:230是什麼意思
A260:A230是分光光度計測量RNA溶液的濃度出現的數值,表示樣品的純度。
1、A260nm:核酸的吸收峰測,測RNA,DNA等的濃度用的。260nm是核酸分子吸收峰的波長,是核酸最高吸收峰的吸收波長,最佳測量值的范圍為0.1至1.0。如果不在此范圍,稀釋或濃縮樣品,使之在此范圍內;如果吸光度小於0.05,檢查是否存在操作因素(如移液不準確,樣品內有懸浮物等)影響。
2、A230nm:測定碳源物質,如酚,糖類等濃度用的,是碳水化合物最高吸收峰的吸收波長,比值可進行核酸樣品純度評估。A230表示樣品在230nm的波長處出現了吸收。在A230處出現吸收峰的原因是樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等。
3、A260:A230可以表徵樣品的純度,A260:A230的比值大於1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低於1.8 或者2.0,表示存在蛋白質或者酚類物質的影響。
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一、RNA質量檢驗。
RNA樣品的品質檢測一般分為總量,純度與完整性三大項。
1、總量:微量分光光度計測260nm吸收值計算。
2、純度:微量分光光度計測260nm/230nm吸收值的比值,用於評估有機溶劑殘留;260nm/280nm吸收值的比值,用於評估蛋白質污染比例。
3、完整性:以Agilent Bioanalyzer進行毛細管電泳(capillary electrophoresis),並以軟體的RIN(RNA Integrity Number)分數評估,10為RNA完整性最好,0為最差。
二、RNA純度。
RNA在純化過程中容易受到DNA、蛋白質及有機溶劑的影響,這些殘存物將會影響以後的操作。
光譜分析(NANODROP)利用物質對不同波長光的吸收度的不同,可以鑒別出溶液純度及濃度。
RNA溶液的A260/A280的比值是一種RNA純度檢測方法,比值范圍一般為1.8-2.1。各項實驗對RNA純度要求不一,比如即使比值超出這個范圍,RNA樣品也一樣可以用於一些普通實驗中,如Northern雜交、RT-PCR、熒光定量PCR和RNA酶保護等實驗。
⑵ rna提取260/230比值多少合適
260/230比值偏小,是有鹽污染,解決的辦法是:
在乙醇洗脫步驟時:
1、75%乙醇,4℃,7500g/min,離心5min;
2、倒掉乙醇,再加入75%乙醇,條件同上,做第二次洗脫(注意,這次EP管在離心機
里的擺放方向與第一次相反,以便能更全面的洗脫);
3、再次掉轉EP管在離心機中的方向(不再加入乙醇),7500g/min,4℃,離心3min
後,用200μl的槍小心吸去乙醇(注意不要吸到管底的RNA),然後開蓋晾乾乙醇即
可。
這樣做後,比只用乙醇洗一次的效果要好很多,我們所提RNA用nanodrop測得260/230
值均在2.0左右。
注意倒掉乙醇後再離心一次,把沾在管壁的乙醇離下來
⑶ 提取rna濃度在多少才算好的
rtpcr時提取rna的濃度和純度要求:濃度20ng/ul以上足夠了,如果用的是組織提取,濃度一般很高,可以達到幾百甚至幾千。如果你用的是病毒、少量細胞,濃度低一些也沒有關系。純度需要用儀器測一下。260/280理論值應該有2.0以上,260/230值1.2以上基本合格。RT-PCR:最重要的是RNA是否有明顯降解,這個需要跑電泳看。一般來說28S應該比18S亮1.5-2.0倍,說明提取得不錯。反轉錄·聚合酶鏈反應(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)是將RNA的反轉錄(reversetranscription)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用從RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞中基因表達水平,細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作為模板的RNA可以是總RNA、mRNA或體外轉錄的RNA產物。無論使用何種RNA,關鍵是確保RNA中無RNA酶和基因組DNA的污染。提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,採用Oligo(dT)或隨機引物利用反轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板經行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。
⑷ 提的RNA260/230在1.0左右可以用嗎
提的RNA260/230在1.0左右可以用。
260/230比值偏小,是有鹽污染,260/230偏小說明溶液中含有有機溶劑,會對酶的效率有影響。
75%乙醇,4℃,7500g/min,離心5min;倒掉乙醇,再加入75%乙醇,條件同上,做第二次洗脫;再次掉轉EP管在離心機中的方向(不再加入乙醇),7500g/min,4℃,離心3min後,用200μl的槍小心吸去乙醇,開蓋晾乾乙醇即可。
飽和與不飽和溶液的互相轉化:
不飽和溶液通過增加溶質(對一切溶液適用)或降低溫度(對於大多數溶解度隨溫度升高而升高的溶質適用,反之則須升高溫度,如石灰水)、蒸發溶劑(溶劑是液體時)能轉化為飽和溶液。
飽和溶液通過增加溶劑(對一切溶液適用)或升高溫度(對於大多數溶解度隨溫度升高而升高的溶質適用,反之則降低溫度,如石灰水)能轉化為不飽和溶液。
⑸ a260/230比值低於1.8能用嗎
不可以用的,數值低於1.8有污染,
輸出結果的含義:
1. A260nm——核酸最高吸收峰的吸收波長。
2. A280nm——蛋白最高吸收峰的吸收波長。
3. A230nm——是碳水化合物最高吸收峰的吸收波長。
4. A340nm——是基線校準波長,為檢測溶液樣品的濁度和其他干擾因子。該值應該接近0.0。如果不是,表明溶液中有懸浮物,需要純化樣品。純樣品的A340一般是0。
● A230產生負值主要是由於在很低 DNA 濃度的溶液中的一些其他成分的干擾所導致的。在下一個測定中,需要降低樣品的稀釋度,A230的負值會被校正。
● A260/A280比值可進行核酸樣品純度評估:純DNA的A260/A280比值為1.8,純 RNA的A260/A280比值為2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚類物質的污染,需要純化樣品。
● A260/A230比值可進行核酸樣品純度評估:純
DNA和RNA的A260/A230比值為 1.8 –
2.2。若比值小於1.8表明樣品被碳水化合物(糖類)、鹽類或有機溶劑污染,需要純化樣品。當 260/230<1
時,通常只有兩種情況。一是胍鹽污染,二是蛋白污染。
dna提取時260/230比值較低。
1. A260/A280、A260/A230比值受溶液酸鹼度及離子強度的影響,如酸溶液會使A260/A280比值降低,低離子強度和低 pH 溶液會增加 280 nm 處的光吸收值。因此必須確保空白檢測和溶解樣品所用Buffer的離子濃度和pH值一致。
2. 濃度接近2 ng/μl濃度的樣品可能會導致不可靠的260/280和/或260/230的比值。
3. 樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素,由於樣品中不可避免存在一些細小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在會干擾測試效果。樣品的濃度不能過低,或者過高(超過光度計的測試范圍)。
⑹ 純的DNA OD260/280在 ,OD260/230應大於 。
260/280應該在1.9左右,反應DNA的質量。260/230也應在1.7左右,反應提取時的有機溶劑是否清洗干凈。
⑺ 植物DNA提取實驗,結果od260、od280、od230都很低,但是od260/280和od260/230值都在正常范圍內,為什麼
一、概念解析
首先我們需要明白的是,OD260和OD280,OD230代表了什麼意思。
1、OD260代表了核酸的吸光度;
2、OD280代表了蛋白質的吸光度;
3、OD230代表了苯酚類等雜質的吸光度;
二、分析如下:
1、由此可見,決定DNA的因素主要是260這個值,而其他的兩個值只是用來判斷樣本中是否有其他雜質,雜質是什麼物質這個問題。
至於後面的OD260/OD280,OD260/OD230這兩個比值,其實就是在滿足以上OD260的情況下才去參考的值,用於區分DNA的純度問題。
2、除去DNA的本質吸光度問題,其他的暫不具有可參考意義,所以及使即使比值是正常的,但不能說明實質性問題。
三、問題查找
1、以上結果首先比對抽提方法,以及使用試劑盒是否符合植物的DNA提取。
2、通過瓊脂糖凝膠電泳或者4200或2100質控DNA的基本屬性,觀察此時值的變化。
3、也可以通過sanger測序簡單驗證,結果更准確。
⑻ 提取的DNA測OD值是260/230小於1.7是什麼原因
比值低於1.8 或者2.0,表示存在蛋白質或者酚類物質的影響。
A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大於2.0。A320檢測溶液的混濁度和其他干擾因子。純樣品,A320一般是0。
A260/A280和A260/A230是核酸純度的指示值。純度好的DNA或RNA,在pH7-8.5下A260 / A280的比值應該在2.0 或2.5。
純凈的樣品比值大於1.8(DNA)或者2.0(RNA)。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物、鹽(胍鹽)等,較純凈的核酸A260/A230的比值大於2.0 。
當 0.5%BSA蛋白質污染時,蛋白污染會導致260和280的數值都下降,其凈結果是260/280比值下降,但260/280的比值變化並不顯著,正如分子克隆3所說。
但蛋白殘留會導致230的數值顯著上升,顯著影響260/230的比值。也就是說,如果RNA樣品的260/280=1.7,260 /230=0.5,那麼就應該考慮污染原因不是胍鹽殘留,而是蛋白殘留。
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測DNA或RNA的OD值的含義:
范圍內表示提取的DNA純度較好,若小於1.7可能有蛋白污染,若大於2.0則說明有RNA污染或者DNA已經降解。260/230測的結果一般作為參考值,RNA提取時如果該值小於2說明裂解液中有異硫氰酸胍和巰基乙醇殘留。
使DNA的純度高,首先樣品量合適,不能反復凍融,研磨時要充分,隨時補充液氮,在樣品未完全解凍前迅速加入裂解液中,後面的操作應盡量柔和,避免造成損傷。
RNA及DNA的提取,260/280測定用來鑒定DNA及RNA的純度。260/280的值在1.8-2.0之間最好。
RNA 260/280<1.8說明有蛋白質、酚的污染,>2.0說明RNA降解。
DNA 260/280<1.8說明有蛋白質污染,>2.0說明RNA污染。
⑼ RNA抽提時 260/230的值不對是什麼原因
260/230的值應該大於2,小於2主要是鹽濃度高了,但一般沒關系。