核酸外切酶加多少合適
『壹』 核酸外切酶 iii能切多少ng基因組dna
核酸外切酶 iii能切多少ng基因組dna
一條DNA有2端,就像一條繩子有兩頭一樣,3『5』核酸外切酶可以從3『端開始降解DNA,而5』3『核酸外切酶可以從5』端降解DNA,這些酶中還可以區別出從分子鏈的3′末端或5′末端開始切斷和對單鏈DNA或雙鏈DNA具有特異作用的酶。可利用這些酶水解方式的差異來分析核酸結構。
水解磷酸二酯鍵的3′端生成5′-單核苷酸的酶,有蛇毒磷酸二酯酶及大腸桿菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等; 水解5′端生成3′-單核苷酸的酶有脾臟磷酸二酯酶、嗜酸乳桿菌(Lac-tobacillus acidophilus)核酸酶。
『貳』 核酸外切酶Ⅲ的加入量一般是多少
核酸的定量測定——定磷法[原理]磷的測定方法很多,Fiske-Subbarow定磷法是一經典的但至今仍被經常採用的方法,它具有靈敏、簡便的特點。各種含磷有機物經硫酸或過氯酸水解,使有機磷消化成為無機磷。無機磷在酸性條件下,與鉬酸鹽(常用鉬酸銨或...
『叄』 3-5 5-3外切酶有什麼區別 作用方式
核酸外切酶 就是將核酸序列3'游離端或者5'游離端逐一水解成減少一個核苷酸長度的核酸鏈和游離的核苷酸
區別就是水解的起點端不一樣
3'→5'核酸外切酶就是從核酸的3'游離羥基端逐一水解核酸鏈
5'→3'是從5'游離磷酸基團端逐一水解核苷酸鏈
從反應的角度看 區別只有反應的方向不一樣
作用方式就是磷酸二酯鍵的水解作用
一般的是水解出3'游離羥基和5'游離磷酸基團
具體細節的反應機理作用方式 參見有機化學的親和取代吧 水作為親核試劑對5'側的磷原子進行親和加成 形成不穩定中間體後 3'側的羥基發生消除反應 和一般的酯類水解類似 不過是在酶的催化作用下完成的一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羥基的活性位點 可以在代替水進行親和進攻 常見的類似的磷酸酯鍵的水解還有 氯解磷定或碘解磷定對未老化的有機磷農葯中毒的乙醯膽鹼酯酶的解毒過程……
『肆』 外切酶的介紹
外切酶即核酸外切酶(exonuclease )。核酸外切酶是一類能從多核苷酸鏈的一端開始按序催化水解3、5-磷酸二酯鍵,降解核苷酸的酶。其水解的最終產物是單個的核苷酸(DNA為dNMP,RNA為NMP)。按作用的特性差異可以將其分為單鏈的核酸外切酶和雙鏈的核酸外切酶。
『伍』 3-5 5-3外切酶有什麼區別 作用方式 詳細點謝謝、
核酸外切酶
就是將核酸序列3'游離端或者5'游離端逐一水解成減少一個核苷酸長度的核酸鏈和游離的核苷酸
區別就是水解的起點端不一樣
3'→5'核酸外切酶就是從核酸的3'游離羥基端逐一水解核酸鏈
5'→3'是從5'游離磷酸基團端逐一水解核苷酸鏈
從反應的角度看
區別只有反應的方向不一樣
作用方式就是磷酸二酯鍵的水解作用
一般的是水解出3'游離羥基和5'游離磷酸基團
具體細節的反應機理作用方式
參見有機化學的親和取代吧
水作為親核試劑對5'側的磷原子進行親和加成
形成不穩定中間體後
3'側的羥基發生消除反應
和一般的酯類水解類似
不過是在酶的催化作用下完成的
一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羥基的活性位點
可以在代替水進行親和進攻
常見的類似的磷酸酯鍵的水解還有
氯解磷定或碘解磷定對未老化的有機磷農葯中毒的乙醯膽鹼酯酶的解毒過程……
『陸』 35核酸外切酶和53核酸外切酶的區別
一、開始降解的端向不同
3『5』核酸外切酶從3『端開始降解DNA,而5』3『核酸外切酶從5』端降解DNA。
二、水解磷酸二酯鍵生成的酶種類不同
水解磷酸二酯鍵的3′端生成5′-單核苷酸的酶,有蛇毒磷酸二酯酶及大腸桿菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等; 水解5′端生成3′-單核苷酸的酶有脾臟磷酸二酯酶、嗜酸乳桿菌(Lac-tobacillus acidophilus)核酸酶。
三、反應的方向不同
一般的是水解出3'游離羥基和5'游離磷酸基團,水作為親核試劑對5'側的磷原子進行親和加成,形成不穩定中間體後 3'側的羥基發生消除反應和一般的酯類水解類似,不過是在酶的催化作用下完成的一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羥基的活性位點,可以在代替水進行親和進攻 。
(6)核酸外切酶加多少合適擴展閱讀
單鏈:單鏈的核酸外切酶包括大腸桿菌核酸外切酶Ⅰ(exoⅠ)和核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)。核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)能夠從5′-末端或3′-末端呈單鏈狀態的DNA分子上降解DNA,產生出寡核苷酸短片段,而且是唯一不需要Mg2+離子的活性酶,是一種耐受性很強的核酸酶。
雙鏈:雙鏈的核酸外切酶包括大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ(exoⅢ)、λ噬菌體核酸外切酶(λexo)以及T7噬菌體基因6核酸外切酶等。大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ(exo Ⅲ)具有多種催化功能,可以降解雙鏈DNA分子中的許多類型的磷酸二酯鍵。
參考資料
網路--外切酶
『柒』 什麼是核酸內切酶什麼是核酸外切酶兩者有什麼區別 介紹請詳細一些.
核酸內切酶 endonuclease
核酸內切酶是在核酸水解酶中,水解DNA分子鏈內部磷酸二酯鍵生成寡/寡聚核苷酸的酶.從對底物的特異性來看,可分為DNaseⅠ、DNaseⅡ等僅分解DNA的酶;脾臟RNase、RNaseT1等僅分解RNA的酶;還有就是如鏈孢霉(Neurospora)核酸酶這類既分解DNA又分解RNA的酶.一般來說,大都不具鹼基特異性,但也有諸如HindⅢ、EcoRⅠ等具有限制性的,能夠識別並切斷特定的鹼基或鹼基序列的酶.
核酸外切酶exonuclease
核酸外切酶是一類能從多核苷酸鏈的一端開始按序催化水解3、5-磷酸二酯鍵,降解核苷酸的酶.其水解的最終產物是單個的核苷酸(DNA為dNTP,RNA為NTP).按作用的特性差異可以將其分為單鏈的核酸外切酶和雙鏈的核酸外切酶.
單鏈的核酸外切酶包括大腸桿菌核酸外切酶Ⅰ(exoⅠ)和核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ).核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)能夠從5′-末端或3′-末端呈單鏈狀態的DNA分子上降解DNA,產生出寡核苷酸短片段,而且是唯一不需要Mg2+離子的活性酶,是一種耐受性很強的核酸酶.核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)可以用來測定基因組DNA中一些特殊的間隔序列和編碼序列的位置.它只切割末端有單鏈突出的DNA分子.
雙鏈的核酸外切酶包括大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ(exoⅢ)、λ噬菌體核酸外切酶(λexo)以及T7噬菌體基因6核酸外切酶等.大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ(exo Ⅲ)具有多種催化功能,可以降解雙鏈DNA分子中的許多類型的磷酸二酯鍵.其中主要的催化活性是催化雙鏈DNA按3′→5′的方向從3′-OH末端釋放5′-單核苷酸.大腸桿菌核酸外切酶Ⅲ(exoⅢ)通過其3′→5′外切酶活性使雙鏈DNA分子產生出單鏈區,經過這種修飾的DNA再配合使用Klenow酶,同時加進帶放射性同位素的核苷酸,便可以制備特異性的放射性探針.
λ噬菌體核酸外切酶(λexo)最初是從感染了λ噬菌體的大腸桿菌細胞中純化出來的.這種酶催化雙鏈DNA分子從5′-P末端進行逐步的水解釋放出5′-單核苷酸.但不能降解5′-OH末端.
『捌』 核酸外切酶
外切酶:從核酸一端一個一個的水解掉核苷酸。
內切酶:從核酸內部特定位點切斷核酸。
『玖』 核酸外切酶是如何作用的
核酸外切酶是從雙鏈核酸中的一條鏈的切口處,從5'端或者3'端逐個切下單核苷酸,即切斷核酸的3',5'-磷酸二酯鍵,產生單核苷酸。(註:核酸就是右單核苷酸通過3',5'-磷酸二酯鍵連接而成)
『拾』 dna聚合酶外切酶活性
DNA聚合酶具有兩種活性,一個是聚合酶活性,5』——3』,意思是說在合成的單鏈或者引物鏈的3』加上與模板鏈互補的脫氧核苷酸
此外,DNA聚合酶還有一個外切酶活性位點,用來校正剪切掉錯誤的脫氧核苷酸.這個活性是3』——5』方向,所以可以將新鏈3』端的錯誤配對脫氧核苷酸去掉.
兩個位點對於DNA的結合能力是不同的,正常情況(即配對正確)下,聚合酶位點的結合能力強,而外切酶位點結合能力弱,因此DNA聚合酶從5』向3』合成雙鏈DNA;當合成時出現錯配的情況,聚合酶位點與錯配鏈的結合能力下降約100倍,而外切酶的結合能力不變,強於此時的聚合酶位點,所以DNA3』端移向外切酶位點,並剪切掉錯誤的配對;當錯誤配對被切掉後,相當於重新回到了正確配對的情況,故而聚合酶位點結合能力再次強於外切酶位點,DNA回到聚合酶位點,繼續合成新鏈.
這是由我們分子生物學的課程中學來的,我們使用的教材是《molecular biology of genes》,由發現DNA雙螺旋的Waston主編
如果你還是不懂,可以將郵箱發給我,我可以將我們上課的課件發給你