260比230值多少合适
⑴ RNA质量中260:230是什么意思
A260:A230是分光光度计测量RNA溶液的浓度出现的数值,表示样品的纯度。
1、A260nm:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA等的浓度用的。260nm是核酸分子吸收峰的波长,是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有悬浮物等)影响。
2、A230nm:测定碳源物质,如酚,糖类等浓度用的,是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估。A230表示样品在230nm的波长处出现了吸收。在A230处出现吸收峰的原因是样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等。
3、A260:A230可以表征样品的纯度,A260:A230的比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。
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一、RNA质量检验。
RNA样品的品质检测一般分为总量,纯度与完整性三大项。
1、总量:微量分光光度计测260nm吸收值计算。
2、纯度:微量分光光度计测260nm/230nm吸收值的比值,用于评估有机溶剂残留;260nm/280nm吸收值的比值,用于评估蛋白质污染比例。
3、完整性:以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性最好,0为最差。
二、RNA纯度。
RNA在纯化过程中容易受到DNA、蛋白质及有机溶剂的影响,这些残存物将会影响以后的操作。
光谱分析(NANODROP)利用物质对不同波长光的吸收度的不同,可以鉴别出溶液纯度及浓度。
RNA溶液的A260/A280的比值是一种RNA纯度检测方法,比值范围一般为1.8-2.1。各项实验对RNA纯度要求不一,比如即使比值超出这个范围,RNA样品也一样可以用于一些普通实验中,如Northern杂交、RT-PCR、荧光定量PCR和RNA酶保护等实验。
⑵ rna提取260/230比值多少合适
260/230比值偏小,是有盐污染,解决的办法是:
在乙醇洗脱步骤时:
1、75%乙醇,4℃,7500g/min,离心5min;
2、倒掉乙醇,再加入75%乙醇,条件同上,做第二次洗脱(注意,这次EP管在离心机
里的摆放方向与第一次相反,以便能更全面的洗脱);
3、再次掉转EP管在离心机中的方向(不再加入乙醇),7500g/min,4℃,离心3min
后,用200μl的枪小心吸去乙醇(注意不要吸到管底的RNA),然后开盖晾干乙醇即
可。
这样做后,比只用乙醇洗一次的效果要好很多,我们所提RNA用nanodrop测得260/230
值均在2.0左右。
注意倒掉乙醇后再离心一次,把沾在管壁的乙醇离下来
⑶ 提取rna浓度在多少才算好的
rtpcr时提取rna的浓度和纯度要求:浓度20ng/ul以上足够了,如果用的是组织提取,浓度一般很高,可以达到几百甚至几千。如果你用的是病毒、少量细胞,浓度低一些也没有关系。纯度需要用仪器测一下。260/280理论值应该有2.0以上,260/230值1.2以上基本合格。RT-PCR:最重要的是RNA是否有明显降解,这个需要跑电泳看。一般来说28S应该比18S亮1.5-2.0倍,说明提取得不错。反转录·聚合酶链反应(reversetranscription-polymerasechainreaction,RT-PCR)是将RNA的反转录(reversetranscription)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染。提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用反转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板经行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
⑷ 提的RNA260/230在1.0左右可以用吗
提的RNA260/230在1.0左右可以用。
260/230比值偏小,是有盐污染,260/230偏小说明溶液中含有有机溶剂,会对酶的效率有影响。
75%乙醇,4℃,7500g/min,离心5min;倒掉乙醇,再加入75%乙醇,条件同上,做第二次洗脱;再次掉转EP管在离心机中的方向(不再加入乙醇),7500g/min,4℃,离心3min后,用200μl的枪小心吸去乙醇,开盖晾干乙醇即可。
饱和与不饱和溶液的互相转化:
不饱和溶液通过增加溶质(对一切溶液适用)或降低温度(对于大多数溶解度随温度升高而升高的溶质适用,反之则须升高温度,如石灰水)、蒸发溶剂(溶剂是液体时)能转化为饱和溶液。
饱和溶液通过增加溶剂(对一切溶液适用)或升高温度(对于大多数溶解度随温度升高而升高的溶质适用,反之则降低温度,如石灰水)能转化为不饱和溶液。
⑸ a260/230比值低于1.8能用吗
不可以用的,数值低于1.8有污染,
输出结果的含义:
1. A260nm——核酸最高吸收峰的吸收波长。
2. A280nm——蛋白最高吸收峰的吸收波长。
3. A230nm——是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长。
4. A340nm——是基线校准波长,为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近0.0。如果不是,表明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。纯样品的A340一般是0。
● A230产生负值主要是由于在很低 DNA 浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。
● A260/A280比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A260/A280比值为1.8,纯 RNA的A260/A280比值为2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。
● A260/A230比值可进行核酸样品纯度评估:纯
DNA和RNA的A260/A230比值为 1.8 –
2.2。若比值小于1.8表明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。当 260/230<1
时,通常只有两种情况。一是胍盐污染,二是蛋白污染。
dna提取时260/230比值较低。
1. A260/A280、A260/A230比值受溶液酸碱度及离子强度的影响,如酸溶液会使A260/A280比值降低,低离子强度和低 pH 溶液会增加 280 nm 处的光吸收值。因此必须确保空白检测和溶解样品所用Buffer的离子浓度和pH值一致。
2. 浓度接近2 ng/μl浓度的样品可能会导致不可靠的260/280和/或260/230的比值。
3. 样品的稀释浓度同样是不可忽视的因素,由于样品中不可避免存在一些细小的颗粒,尤其是核酸样品。这些小颗粒的存在会干扰测试效果。样品的浓度不能过低,或者过高(超过光度计的测试范围)。
⑹ 纯的DNA OD260/280在 ,OD260/230应大于 。
260/280应该在1.9左右,反应DNA的质量。260/230也应在1.7左右,反应提取时的有机溶剂是否清洗干净。
⑺ 植物DNA提取实验,结果od260、od280、od230都很低,但是od260/280和od260/230值都在正常范围内,为什么
一、概念解析
首先我们需要明白的是,OD260和OD280,OD230代表了什么意思。
1、OD260代表了核酸的吸光度;
2、OD280代表了蛋白质的吸光度;
3、OD230代表了苯酚类等杂质的吸光度;
二、分析如下:
1、由此可见,决定DNA的因素主要是260这个值,而其他的两个值只是用来判断样本中是否有其他杂质,杂质是什么物质这个问题。
至于后面的OD260/OD280,OD260/OD230这两个比值,其实就是在满足以上OD260的情况下才去参考的值,用于区分DNA的纯度问题。
2、除去DNA的本质吸光度问题,其他的暂不具有可参考意义,所以及使即使比值是正常的,但不能说明实质性问题。
三、问题查找
1、以上结果首先比对抽提方法,以及使用试剂盒是否符合植物的DNA提取。
2、通过琼脂糖凝胶电泳或者4200或2100质控DNA的基本属性,观察此时值的变化。
3、也可以通过sanger测序简单验证,结果更准确。
⑻ 提取的DNA测OD值是260/230小于1.7是什么原因
比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。
A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320检测溶液的混浊度和其他干扰因子。纯样品,A320一般是0。
A260/A280和A260/A230是核酸纯度的指示值。纯度好的DNA或RNA,在pH7-8.5下A260 / A280的比值应该在2.0 或2.5。
纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0 。
当 0.5%BSA蛋白质污染时,蛋白污染会导致260和280的数值都下降,其净结果是260/280比值下降,但260/280的比值变化并不显着,正如分子克隆3所说。
但蛋白残留会导致230的数值显着上升,显着影响260/230的比值。也就是说,如果RNA样品的260/280=1.7,260 /230=0.5,那么就应该考虑污染原因不是胍盐残留,而是蛋白残留。
(8)260比230值多少合适扩展阅读
测DNA或RNA的OD值的含义:
范围内表示提取的DNA纯度较好,若小于1.7可能有蛋白污染,若大于2.0则说明有RNA污染或者DNA已经降解。260/230测的结果一般作为参考值,RNA提取时如果该值小于2说明裂解液中有异硫氰酸胍和巯基乙醇残留。
使DNA的纯度高,首先样品量合适,不能反复冻融,研磨时要充分,随时补充液氮,在样品未完全解冻前迅速加入裂解液中,后面的操作应尽量柔和,避免造成损伤。
RNA及DNA的提取,260/280测定用来鉴定DNA及RNA的纯度。260/280的值在1.8-2.0之间最好。
RNA 260/280<1.8说明有蛋白质、酚的污染,>2.0说明RNA降解。
DNA 260/280<1.8说明有蛋白质污染,>2.0说明RNA污染。
⑼ RNA抽提时 260/230的值不对是什么原因
260/230的值应该大于2,小于2主要是盐浓度高了,但一般没关系。