核酸外切酶加多少合适
‘壹’ 核酸外切酶 iii能切多少ng基因组dna
核酸外切酶 iii能切多少ng基因组dna
一条DNA有2端,就像一条绳子有两头一样,3‘5’核酸外切酶可以从3‘端开始降解DNA,而5’3‘核酸外切酶可以从5’端降解DNA,这些酶中还可以区别出从分子链的3′末端或5′末端开始切断和对单链DNA或双链DNA具有特异作用的酶。可利用这些酶水解方式的差异来分析核酸结构。
水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶,有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等; 水解5′端生成3′-单核苷酸的酶有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌(Lac-tobacillus acidophilus)核酸酶。
‘贰’ 核酸外切酶Ⅲ的加入量一般是多少
核酸的定量测定——定磷法[原理]磷的测定方法很多,Fiske-Subbarow定磷法是一经典的但至今仍被经常采用的方法,它具有灵敏、简便的特点。各种含磷有机物经硫酸或过氯酸水解,使有机磷消化成为无机磷。无机磷在酸性条件下,与钼酸盐(常用钼酸铵或...
‘叁’ 3-5 5-3外切酶有什么区别 作用方式
核酸外切酶 就是将核酸序列3'游离端或者5'游离端逐一水解成减少一个核苷酸长度的核酸链和游离的核苷酸
区别就是水解的起点端不一样
3'→5'核酸外切酶就是从核酸的3'游离羟基端逐一水解核酸链
5'→3'是从5'游离磷酸基团端逐一水解核苷酸链
从反应的角度看 区别只有反应的方向不一样
作用方式就是磷酸二酯键的水解作用
一般的是水解出3'游离羟基和5'游离磷酸基团
具体细节的反应机理作用方式 参见有机化学的亲和取代吧 水作为亲核试剂对5'侧的磷原子进行亲和加成 形成不稳定中间体后 3'侧的羟基发生消除反应 和一般的酯类水解类似 不过是在酶的催化作用下完成的一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羟基的活性位点 可以在代替水进行亲和进攻 常见的类似的磷酸酯键的水解还有 氯解磷定或碘解磷定对未老化的有机磷农药中毒的乙酰胆碱酯酶的解毒过程……
‘肆’ 外切酶的介绍
外切酶即核酸外切酶(exonuclease )。核酸外切酶是一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水解3、5-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。其水解的最终产物是单个的核苷酸(DNA为dNMP,RNA为NMP)。按作用的特性差异可以将其分为单链的核酸外切酶和双链的核酸外切酶。
‘伍’ 3-5 5-3外切酶有什么区别 作用方式 详细点谢谢、
核酸外切酶
就是将核酸序列3'游离端或者5'游离端逐一水解成减少一个核苷酸长度的核酸链和游离的核苷酸
区别就是水解的起点端不一样
3'→5'核酸外切酶就是从核酸的3'游离羟基端逐一水解核酸链
5'→3'是从5'游离磷酸基团端逐一水解核苷酸链
从反应的角度看
区别只有反应的方向不一样
作用方式就是磷酸二酯键的水解作用
一般的是水解出3'游离羟基和5'游离磷酸基团
具体细节的反应机理作用方式
参见有机化学的亲和取代吧
水作为亲核试剂对5'侧的磷原子进行亲和加成
形成不稳定中间体后
3'侧的羟基发生消除反应
和一般的酯类水解类似
不过是在酶的催化作用下完成的
一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羟基的活性位点
可以在代替水进行亲和进攻
常见的类似的磷酸酯键的水解还有
氯解磷定或碘解磷定对未老化的有机磷农药中毒的乙酰胆碱酯酶的解毒过程……
‘陆’ 35核酸外切酶和53核酸外切酶的区别
一、开始降解的端向不同
3‘5’核酸外切酶从3‘端开始降解DNA,而5’3‘核酸外切酶从5’端降解DNA。
二、水解磷酸二酯键生成的酶种类不同
水解磷酸二酯键的3′端生成5′-单核苷酸的酶,有蛇毒磷酸二酯酶及大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ等; 水解5′端生成3′-单核苷酸的酶有脾脏磷酸二酯酶、嗜酸乳杆菌(Lac-tobacillus acidophilus)核酸酶。
三、反应的方向不同
一般的是水解出3'游离羟基和5'游离磷酸基团,水作为亲核试剂对5'侧的磷原子进行亲和加成,形成不稳定中间体后 3'侧的羟基发生消除反应和一般的酯类水解类似,不过是在酶的催化作用下完成的一般的水解酶中有Ser或者Tyr等含有羟基的活性位点,可以在代替水进行亲和进攻 。
(6)核酸外切酶加多少合适扩展阅读
单链:单链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ(exoⅠ)和核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)。核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)能够从5′-末端或3′-末端呈单链状态的DNA分子上降解DNA,产生出寡核苷酸短片段,而且是唯一不需要Mg2+离子的活性酶,是一种耐受性很强的核酸酶。
双链:双链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ(exoⅢ)、λ噬菌体核酸外切酶(λexo)以及T7噬菌体基因6核酸外切酶等。大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ(exo Ⅲ)具有多种催化功能,可以降解双链DNA分子中的许多类型的磷酸二酯键。
参考资料
网络--外切酶
‘柒’ 什么是核酸内切酶什么是核酸外切酶两者有什么区别 介绍请详细一些.
核酸内切酶 endonuclease
核酸内切酶是在核酸水解酶中,水解DNA分子链内部磷酸二酯键生成寡/寡聚核苷酸的酶.从对底物的特异性来看,可分为DNaseⅠ、DNaseⅡ等仅分解DNA的酶;脾脏RNase、RNaseT1等仅分解RNA的酶;还有就是如链孢霉(Neurospora)核酸酶这类既分解DNA又分解RNA的酶.一般来说,大都不具碱基特异性,但也有诸如HindⅢ、EcoRⅠ等具有限制性的,能够识别并切断特定的碱基或碱基序列的酶.
核酸外切酶exonuclease
核酸外切酶是一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水解3、5-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶.其水解的最终产物是单个的核苷酸(DNA为dNTP,RNA为NTP).按作用的特性差异可以将其分为单链的核酸外切酶和双链的核酸外切酶.
单链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅰ(exoⅠ)和核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ).核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)能够从5′-末端或3′-末端呈单链状态的DNA分子上降解DNA,产生出寡核苷酸短片段,而且是唯一不需要Mg2+离子的活性酶,是一种耐受性很强的核酸酶.核酸外切酶Ⅶ(exoⅦ)可以用来测定基因组DNA中一些特殊的间隔序列和编码序列的位置.它只切割末端有单链突出的DNA分子.
双链的核酸外切酶包括大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ(exoⅢ)、λ噬菌体核酸外切酶(λexo)以及T7噬菌体基因6核酸外切酶等.大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ(exo Ⅲ)具有多种催化功能,可以降解双链DNA分子中的许多类型的磷酸二酯键.其中主要的催化活性是催化双链DNA按3′→5′的方向从3′-OH末端释放5′-单核苷酸.大肠杆菌核酸外切酶Ⅲ(exoⅢ)通过其3′→5′外切酶活性使双链DNA分子产生出单链区,经过这种修饰的DNA再配合使用Klenow酶,同时加进带放射性同位素的核苷酸,便可以制备特异性的放射性探针.
λ噬菌体核酸外切酶(λexo)最初是从感染了λ噬菌体的大肠杆菌细胞中纯化出来的.这种酶催化双链DNA分子从5′-P末端进行逐步的水解释放出5′-单核苷酸.但不能降解5′-OH末端.
‘捌’ 核酸外切酶
外切酶:从核酸一端一个一个的水解掉核苷酸。
内切酶:从核酸内部特定位点切断核酸。
‘玖’ 核酸外切酶是如何作用的
核酸外切酶是从双链核酸中的一条链的切口处,从5'端或者3'端逐个切下单核苷酸,即切断核酸的3',5'-磷酸二酯键,产生单核苷酸。(注:核酸就是右单核苷酸通过3',5'-磷酸二酯键连接而成)
‘拾’ dna聚合酶外切酶活性
DNA聚合酶具有两种活性,一个是聚合酶活性,5’——3’,意思是说在合成的单链或者引物链的3’加上与模板链互补的脱氧核苷酸
此外,DNA聚合酶还有一个外切酶活性位点,用来校正剪切掉错误的脱氧核苷酸.这个活性是3’——5’方向,所以可以将新链3’端的错误配对脱氧核苷酸去掉.
两个位点对于DNA的结合能力是不同的,正常情况(即配对正确)下,聚合酶位点的结合能力强,而外切酶位点结合能力弱,因此DNA聚合酶从5’向3’合成双链DNA;当合成时出现错配的情况,聚合酶位点与错配链的结合能力下降约100倍,而外切酶的结合能力不变,强于此时的聚合酶位点,所以DNA3’端移向外切酶位点,并剪切掉错误的配对;当错误配对被切掉后,相当于重新回到了正确配对的情况,故而聚合酶位点结合能力再次强于外切酶位点,DNA回到聚合酶位点,继续合成新链.
这是由我们分子生物学的课程中学来的,我们使用的教材是《molecular biology of genes》,由发现DNA双螺旋的Waston主编
如果你还是不懂,可以将邮箱发给我,我可以将我们上课的课件发给你